موسسه پژوهشی شیخ بهایی تا بحال چندین همایش علمی بر اساس آیین نامه های مصوب «برگزاری همایش های علمی» با کسب مجوز از معاونت پژوهشی وزارت علوم و پایگاه ISC برگزار کرده است.